As atividades de Educação Ambiental do Projeto Pinípedes do Sul são desenvolvidas principalmente com os pescadores e suas comunidades, com o objetivo de disseminar informações sobre os pinípedes, tartarugas marinhas e os ecossistemas costeiros e marinhos, valorizando o conhecimento local e promovendo a adoção de práticas ambientalmente sustentáveis.
Para tal, são promovidas atividades na Sala do Pescador, embarques com Observadores de Bordo, ações nas escolas das comunidades pesqueiras e ações de formação em “Artesanato da Conservação” para mulheres destas comunidades.